L'actual edifici

Des de 1982, el Museu de Prehistòria ocupa una part de l’antiga Casa de Beneficència, edifici construït en 1841 del qual destaca l’església, decorada en 1881, d’estil bizantí.

L’any 1995 s’inaugura la restauració completa de l’edifici, duta a terme per l’arquitecte Rafael Rivera.

La Casa de Beneficència, actual Museu de Prehistòria consta de planta baixa i dos pisos disposats entorn de cinc patis. En la planta baixa es troben la Botiga, la Cafeteria, dues Sales d’Exposicions Temporals, els Tallers Didàctics, els Magatzems i els Laboratoris de Restauració i Fauna Quaternària, així com els despatxos i dependències del Servici d’Investigació Prehistòrica, mentre que l’Església s'ha convertit en Sala d’Actes.

En la primera planta es troben la Biblioteca i les Sales Permanents dedicades al Paleolític, Neolític, Edat del Bronze i Història del diners. En la segona planta les Sales permanents dedicades a la Cultura Ibèrica i al Món Romà.